Investigadores do Consello Superior de Investigacións Científicas (CSIC), en colaboración coa Fundación Jiménez Díaz, descubriron que pacientes vacinados e infectados coa variante alfa durante a terceira onda da pandemia de covid (entre xaneiro e marzo de 2021) xa presentaban mutacións características de variantes delta plus, iota e ómicron. Este estudo interdisciplinar, publicado en The Journal of Clinical Investigation, analizou en detalle por primeira vez en España mostras de hisopos nasofarínxeos correspondentes a pacientes vacinados e posteriormente infectados durante a terceira onda da pandemia.
Este estudo puido desenvolverse grazas ao traballo previo de posta a punto dunha potente metodoloxía de secuenciación ultra profunda que permite detectar secuencias víricas mutadas que se achan en proporcións moi baixas e que non son detectables polas técnicas de secuenciación habituais de pouca profundidade. “De cada mostra analizada e de cada anaco do virus analizado obtemos moitos miles de secuencias; isto permítenos detectar mutacións a distintos niveis de frecuencia coexistindo dentro do paciente infectado”, explica Celia Perales, investigadora do Centro Nacional de Biotecnoloxía (CNB-CSIC) e do Instituto de Investigación Sanitaria da Fundación Jiménez Díaz.
Resultados
Os resultados desvelaron que a pesar de que os pacientes se infectaron coa variante alfa, predominante nesa data (entre xaneiro e marzo de 2021), cambios correspondentes a variantes delta plus, iota e ómicron, xa estaban presentes nesas mostras meses antes de que adquirisen relevancia epidemiolóxica. “Este traballo resalta a necesidade de analizar as poboacións de virus con alta resolución e en profundidade para obter unha visión conxunta dos moitos mutantes que coexisten en cada individuo infectado”, destaca Esteban Domingo, investigador do Centro de Bioloxía Molecular Severo Ochoa (CBMSO-CSIC-UAM).
Malia que os pacientes se infectaron con alfa, cambios correspondentes a delta plus, iota e ómicron xa estaban presentes nesas mostras
Estas análises poderían permitir o seguimento de mutacións, ou conxunto de mutacións, potencialmente relevantes con anterioridade a que poidan formar parte de variantes perigosas. Dous dos autores deste traballo, Celia Perales e Esteban Domingo, pertencen ademais ao Centro de Investigación Biomédica en Rede de enfermidades hepáticas e dixestivas (CIBERehd), do Instituto de Saúde Carlos III. Grazas a iso, os conceptos sobre variabilidade do virus da hepatite C que durante anos estiveron desenvolvendo poden ser agora aplicados ao virus causante da covid-19.
Referencia: Vaccine-breakthrough infections with SARS-CoV-2 Alpha mirror mutations in Delta Plus, Iota and Omicron (Publicado en The Journal of Clinical Investigation).
